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行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)
05-25
2019
數(shù)據(jù)處理與分析成果。
發(fā)布者:本網(wǎng)站 瀏覽次數(shù):1398
SSR（簡單重復(fù)序列）也稱微衛(wèi)星DNA，其串聯(lián)重復(fù)的核心序列為1~6
bp，其中最常見是雙核苷酸重復(fù)，如：(CA)n和(TG)n，每個(gè)微衛(wèi)星的核心序列結(jié)構(gòu)相同，重復(fù)單位數(shù)目10~60個(gè)，其高度多態(tài)性主要來源于串聯(lián)數(shù)目的不同。SSR標(biāo)記的基本原理：由于微衛(wèi)星兩端的序列一般是保守的，因此可以通過微衛(wèi)星的側(cè)翼序列設(shè)計(jì)引物，通過PCR擴(kuò)增出長度不同的PCR片段，將PCR產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳，根據(jù)分離片段的大小決定基因型并計(jì)算等位基因頻率。
SSR具有以下一些優(yōu)點(diǎn)：（1）一般檢測到的是一個(gè)單一的多等位基因位點(diǎn);⑵微衛(wèi)星呈共顯性遺傳，故可鑒別雜合子和純合子;⑶所需DNA量少。顯然，在采用SSR技術(shù)分析微衛(wèi)星DNA多態(tài)性時(shí)必須知道重復(fù)序列兩端的DNA序列的信息。如不能直接從DNA數(shù)據(jù)庫查尋則首先必須對其進(jìn)行測序。
SSR具有以下一些優(yōu)點(diǎn)：（1）一般檢測到的是一個(gè)單一的多等位基因位點(diǎn);⑵微衛(wèi)星呈共顯性遺傳，故可鑒別雜合子和純合子;⑶所需DNA量少。顯然，在采用SSR技術(shù)分析微衛(wèi)星DNA多態(tài)性時(shí)必須知道重復(fù)序列兩端的DNA序列的信息。如不能直接從DNA數(shù)據(jù)庫查尋則首先必須對其進(jìn)行測序。